2002年，原铁道部科学研究院直属企业“北京远通城市轨道交通中心”和“铁科院工程建设监理部”按照铁道科学研究院改制规划合并，在此基础上成立了“铁科院（北京）工程咨询有限公司”。铁科院（北京）工程咨询有限公司成立以来，自承铁科院“自强不息，厚德载物”的准则，建立起了自己独特的企业文化,使公司成为三家股东单位科研成果转化、推动轨道交通技术和其他相关技术进步的窗口、平台和桥梁。